系统评估测序统计数据、比对率、RNA完整性、mRNA污染程度及 run-on 效率。
对蛋白编码基因、lncRNA 和 eRNA 进行转录水平定量,支持差异表达分析。
计算启动子近端暂停指数,鉴定细胞类型特异性暂停位点。
鉴定具有 eRNA 特征的活性增强子,推断增强子-启动子互作网络。